1961 年 12 月初国防部收到了 9 家公司的方案，只有诺斯罗普拒绝了邀请。在 1962 年 1 月 19 日的第一次方案评估中，美国空军遴选委员会和一位海军代表审核通过了波音的方案，但空军委员会以需要进一步完善为由否决了波音的方案。1962 年 1 月末，美国空军和海军一致同意没有一种方案能被真正接受，但其中两个——波音和通用动力的方案——值得进一步研究，这两个公司都获得了一份合同以完善方案。
1962 年春，波音和通用动力提交了修改后的方案。1962 年 5 月美国空军部和海军部以缺乏足够的数据为由都否决了两家公司的新方案。6 月又进行了第三次提交，这次空军通过了波音的方案，但是海军对自己的海军型却不满意，决绝接受该方案。沮丧的麦克纳马拉命令在年底进行最终竞标，评分采用一个基于性能、成本和通用性指标的分类计分系统。
1962 年 9 月波音和通用动力提交了最终方案。空军委员会、空军后勤司令部和海军武器局（1959 年被海军航空局取代）都表示首选波音的设计。但是在 1962 年 11 月 24 日国防部宣布通用动力的方案获胜，理由是通用动力公司承诺有更大的通用性并且据说有解决成本问题的更现实的办法。
为此引发了一场政治风暴，亨瑞·杰克逊参议员在国会发起一场抗议，大声谴责国防部的选择并明确的依据。波音公司位于杰克逊的家乡华盛顿州，如果通用动力获胜的话，该州会失去许多工作岗位。为此美国国会开展了一系列的调查，TFX 在几个月内都是头条新闻。尽管如此国防部长仍坚持最初的选择，与通用动力签署了合同。
Armstrong
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F-111A 和 B 共享相同的主结构，相同的燃油系统，相同的两台普惠 TF30-P-1 涡扇发动机，相同的并列双座座舱。并列双座是对海军需求的让步，出于解决并列弹射时序不一致，乘员会遭受火箭尾焰吹袭的问题，海军还坚持座舱可以作为一个整体救生舱弹射并伞降。由于需要适应航母升降机尺寸，F-111B 的机鼻比 F-111A 短 2.59 米。F-111B 的翼展还长了 1.07 米以增加翼面积，来满足续航时间的要求。海军型将安装一部休斯 AN/AWG-9 脉冲多普勒雷达，并挂载 6 枚休斯“不死鸟”导弹，这些都是 F6D 项目的遗产。空军型将安装通用电气的 AN/APQ-113 攻击雷达和德州仪器的 AN/APQ-110 地形跟踪雷达，并挂载空地武器。
1962 年 12 月 21 日国防部修订了最初按照通用动力二次提交方案签订的书面合同，并开始采购 18 架 F-111A（63-9766~9782）和 5 架 F-111B（BuNos 151970~151924）。这些是仅用于研究、发展、试飞和评估（RDT&A）的飞机。